Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEMFO60524 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEMFO60524 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEMFO60524 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEMFO60524 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEMFO60524 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEMFO60524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEMFO60524 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEMFO60524 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEMFO60524 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEMFO60524 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEMFO60524 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEMFO60524 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms