Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP5Q9NZZ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms