Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms