Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms