Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCN3Q96D15 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms