Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFV5

SPDYE1, Speedy protein E1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE1Q8NFV5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDYE1Q8NFV5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDYE1Q8NFV5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms