Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms