Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms