Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1H3Q13133 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1H3Q13133 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
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