Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDPQ00604 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDPQ00604 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDPQ00604 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms