Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL31P62899 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL31P62899 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL31P62899 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms