Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL3RAP26951 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms