Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ARF5-206ENST00000489673 566 ntTSL 217.53■□□□□ 0.43e-14■■■■■ 41
DDX3XO00571 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 516.88■□□□□ 0.293e-14■■■■■ 41
DDX3XO00571 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-14■■■■■ 41
DDX3XO00571 ARF5-202ENST00000415666 546 ntTSL 512.58□□□□□ -0.43e-14■■■■■ 41
DDX3XO00571 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.945e-23■■■■■ 41
DDX3XO00571 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-23■■■■■ 41
DDX3XO00571 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.555e-23■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 524.02■■□□□ 1.446e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 519.88■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 517.58■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 513.79□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 512.27□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 56.88□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 41
DDX3XO00571 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.694e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.364e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 422.18■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ASB13-203ENST00000479033 2565 ntTSL 220.39■□□□□ 0.851e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 419.82■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 219.75■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 TST-203ENST00000438203 451 ntTSL 319.4■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 218.05■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 41
DDX3XO00571 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 RIPK1-203ENST00000479389 1481 ntTSL 316.53■□□□□ 0.243e-17■■■■■ 41
DDX3XO00571 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-17■■■■■ 41
DDX3XO00571 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.143e-17■■■■■ 41
DDX3XO00571 SNHG15-208ENST00000584327 505 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.536e-14■■■■■ 41
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-201ENST00000399886 857 ntTSL 311.47□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-18■■■■■ 41
DDX3XO00571 LSM4-205ENST00000597776 446 ntTSL 210.55□□□□□ -0.722e-52■■■■■ 41
DDX3XO00571 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.283e-8■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.154e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.434e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.64e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 410□□□□□ -0.811e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.684e-12■■■■■ 40.9
DDX3XO00571 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.215e-16■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.638e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 PIGX-205ENST00000426755 744 ntTSL 37.82□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.71e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-207ENST00000526711 1594 ntTSL 216.06■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-208ENST00000527121 891 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-211ENST00000530016 1696 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 ILK-205ENST00000526114 851 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 PRKD3-203ENST00000443187 695 ntTSL 411.52□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 RFWD3-206ENST00000572840 458 ntTSL 28.71□□□□□ -1.024e-13■■■■■ 40.8
DDX3XO00571 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-14■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 WIPI1-204ENST00000586815 780 ntTSL 322.66■■□□□ 1.221e-48■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 WIPI1-206ENST00000589316 1886 ntTSL 521.21■□□□□ 0.991e-48■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 WIPI1-207ENST00000589459 1804 ntTSL 519.9■□□□□ 0.781e-48■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-48■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-48■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 LSM1-205ENST00000523511 700 ntTSL 316.64■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 DGAT2-209ENST00000605608 635 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.687e-18■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-12■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 40.7
DDX3XO00571 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC10□□□□□ -0.817e-8■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.793e-11■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.953e-11■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.523e-11■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-204ENST00000577393 531 ntTSL 427.15■■□□□ 1.945e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.231e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 CENPS-205ENST00000602486 312 ntTSL 322.66■■□□□ 1.221e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 321.88■■□□□ 1.095e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 421.49■■□□□ 1.035e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 319.28■□□□□ 0.685e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 213.44□□□□□ -0.265e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-218ENST00000580745 535 ntTSL 411.25□□□□□ -0.615e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-208ENST00000578178 468 ntTSL 411.2□□□□□ -0.625e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 510.53□□□□□ -0.725e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-224ENST00000583092 554 ntTSL 410.25□□□□□ -0.775e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 CENPS-201ENST00000309048 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.861e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 PPP4R1-211ENST00000578875 580 ntTSL 47.37□□□□□ -1.235e-13■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-16■■■■■ 40.6
DDX3XO00571 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-22■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-22■■■■■ 40.5
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