Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBRD1Q9NUN5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD1Q9NUN5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD1Q9NUN5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms