Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms