Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL5Q93034 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL5Q93034 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms