Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM12Q3MHD2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms