Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD4Q14CM0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD4Q14CM0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms