Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEUROD1Q13562 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEUROD1Q13562 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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