Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTA1Q13424 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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