Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.865e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MAGED2-208ENST00000463787 662 ntTSL 39.67□□□□□ -0.866e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 313.25□□□□□ -0.292e-10■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MTHFD1-207ENST00000554677 783 ntTSL 315.09■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.175e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 219.88■□□□□ 0.775e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.665e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 520.15■□□□□ 0.823e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 518.15■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 214.81□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.293e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 BAZ2A-209ENST00000549763 657 ntTSL 311.83□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 310.63□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-9■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 AKR1A1-212ENST00000496999 775 ntTSL 220.9■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■□□ 16.3
G3BP1Q13283 DDB1-212ENST00000538470 858 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ETV5-205ENST00000433149 366 ntTSL 511.21□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 AKR1C1-203ENST00000442997 744 ntTSL 312.93□□□□□ -0.345e-9■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.845e-9■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 AKR1C1-205ENST00000477661 2637 ntTSL 58.96□□□□□ -0.985e-9■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 411.92□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.932e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 IPO4-212ENST00000560222 573 ntTSL 319.84■□□□□ 0.774e-12■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 IPO4-202ENST00000557996 530 ntTSL 419.07■□□□□ 0.644e-12■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 IPO4-216ENST00000561034 535 ntTSL 417.29■□□□□ 0.364e-12■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 IPO4-213ENST00000560315 558 ntTSL 216.22■□□□□ 0.194e-12■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 GPT2-204ENST00000562801 2092 ntTSL 218.78■□□□□ 0.66e-9■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PGD-202ENST00000460189 767 ntTSL 216.4■□□□□ 0.221e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 422.46■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 521.63■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.831e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 COPG1-209ENST00000514478 734 ntTSL 310.98□□□□□ -0.658e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 217.27■□□□□ 0.361e-9■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.017e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-205ENST00000430182 2399 ntTSL 214.9□□□□□ -0.027e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-248ENST00000636669 2410 ntTSL 514.88□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.267e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-247ENST00000636018 2171 ntTSL 513□□□□□ -0.337e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.447e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 DDX18-206ENST00000489933 720 ntTSL 26.16□□□□□ -1.424e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-211ENST00000634308 4321 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 DIP2B-203ENST00000546732 3514 ntTSL 210.68□□□□□ -0.73e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.93e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 VARS-228ENST00000495010 1007 ntTSL 517.54■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PDHB-205ENST00000469827 586 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 PDHB-209ENST00000482894 581 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.592e-8■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 222.22■■□□□ 1.151e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 322.22■■□□□ 1.151e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 KPNA2-206ENST00000583392 507 ntTSL 22.68□□□□□ -1.984e-7■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 229.14■■■□□ 2.268e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.88e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.558e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 223.37■■□□□ 1.338e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.178e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.628e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.478e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.428e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.038e-11■■■□□ 16.2
G3BP1Q13283 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 416.93■□□□□ 0.34e-10■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 ACY1-220ENST00000637149 386 ntTSL 314.96□□□□□ -0.015e-7■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.54□□□□□ -1.22e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.447e-10■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 LAP3-206ENST00000508497 651 ntTSL 310.12□□□□□ -0.793e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 AHSA1-203ENST00000553374 763 ntTSL 29.35□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 IPO4-204ENST00000558193 555 ntTSL 424.27■■□□□ 1.481e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 IPO4-206ENST00000558718 554 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 G6PD-210ENST00000497281 532 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 16.1
G3BP1Q13283 HSPA9-204ENST00000504902 887 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-7■■■□□ 16.1
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 20 ms