RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557996.1

IPO4-202, Transcript of importin 4, humanhuman

TSL 4

Gene IPO4, Length 530 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO4-202ENST00000557996 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.99■■■■□ 3.51
IPO4-202ENST00000557996 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.74■■■□□ 2.83
IPO4-202ENST00000557996 ABCC9O60706 1549 aa31.99■■■□□ 2.71
IPO4-202ENST00000557996 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.92■■■□□ 2.54
IPO4-202ENST00000557996 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
IPO4-202ENST00000557996 NACADO15069 1562 aa30.82■■■□□ 2.52
IPO4-202ENST00000557996 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.81■■■□□ 2.52
IPO4-202ENST00000557996 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.71■■■□□ 2.51
IPO4-202ENST00000557996 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.62■■■□□ 2.49
IPO4-202ENST00000557996 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.392e-6■□□□□ 9.6
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IPO4-202ENST00000557996 SCRIBQ14160 1630 aa29.91■■■□□ 2.38
IPO4-202ENST00000557996 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.85■■■□□ 2.37
IPO4-202ENST00000557996 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
IPO4-202ENST00000557996 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.27■■■□□ 2.28
IPO4-202ENST00000557996 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
IPO4-202ENST00000557996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.9■■■□□ 2.22
IPO4-202ENST00000557996 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.8■■■□□ 2.2
IPO4-202ENST00000557996 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
IPO4-202ENST00000557996 SMARCA4P51532 1647 aa28.63■■■□□ 2.17
IPO4-202ENST00000557996 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.5■■■□□ 2.15
IPO4-202ENST00000557996 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.5■■■□□ 2.15
IPO4-202ENST00000557996 NCAPD3P42695 1498 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO4-202ENST00000557996 SMARCA2P51531 1590 aa28.45■■■□□ 2.14
IPO4-202ENST00000557996 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.36■■■□□ 2.13
IPO4-202ENST00000557996 HMGXB3Q12766 1538 aa28.3■■■□□ 2.12
IPO4-202ENST00000557996 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
IPO4-202ENST00000557996 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
IPO4-202ENST00000557996 WIZO95785 1651 aa28.15■■■□□ 2.1
IPO4-202ENST00000557996 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
IPO4-202ENST00000557996 NESP48681 1621 aa27.7■■■□□ 2.03
IPO4-202ENST00000557996 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
IPO4-202ENST00000557996 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.67■■■□□ 2.02
IPO4-202ENST00000557996 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.65■■■□□ 2.02
IPO4-202ENST00000557996 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.6■■■□□ 2.01
IPO4-202ENST00000557996 ERCC6Q03468 1493 aa27.57■■■□□ 2
IPO4-202ENST00000557996 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.52■■■□□ 2
IPO4-202ENST00000557996 CFTRP13569 1480 aa27.51■■■□□ 2
IPO4-202ENST00000557996 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.32■■□□□ 1.96
IPO4-202ENST00000557996 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.29■■□□□ 1.96
IPO4-202ENST00000557996 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.27■■□□□ 1.96
IPO4-202ENST00000557996 CUX2O14529 1486 aa27.24■■□□□ 1.95
IPO4-202ENST00000557996 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
IPO4-202ENST00000557996 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.2■■□□□ 1.95
IPO4-202ENST00000557996 PRDM2Q13029 1718 aa27.13■■□□□ 1.93
IPO4-202ENST00000557996 WDR62O43379 1518 aa27.08■■□□□ 1.93
IPO4-202ENST00000557996 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
IPO4-202ENST00000557996 ABCC8Q09428 1581 aa26.92■■□□□ 1.9
IPO4-202ENST00000557996 TOPBP1Q92547 1522 aa26.89■■□□□ 1.89
IPO4-202ENST00000557996 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.84■■□□□ 1.89
IPO4-202ENST00000557996 CUX1P39880 1505 aa26.72■■□□□ 1.87
IPO4-202ENST00000557996 IFT140Q96RY7 1462 aa26.71■■□□□ 1.87
IPO4-202ENST00000557996 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
IPO4-202ENST00000557996 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
IPO4-202ENST00000557996 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.62■■□□□ 1.85
IPO4-202ENST00000557996 SOGA1O94964 1423 aa26.6■■□□□ 1.85
IPO4-202ENST00000557996 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.58■■□□□ 1.85
IPO4-202ENST00000557996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.56■■□□□ 1.84
IPO4-202ENST00000557996 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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IPO4-202ENST00000557996 TOP2BQ02880 1626 aa26.51■■□□□ 1.83
IPO4-202ENST00000557996 SYNJ1O43426 1573 aa26.5■■□□□ 1.83
IPO4-202ENST00000557996 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.48■■□□□ 1.83
IPO4-202ENST00000557996 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.824e-6■■■■□ 26.7
IPO4-202ENST00000557996 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
IPO4-202ENST00000557996 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
IPO4-202ENST00000557996 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.38■■□□□ 1.81
IPO4-202ENST00000557996 WDR97A6NE52 1622 aa26.36■■□□□ 1.81
IPO4-202ENST00000557996 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
IPO4-202ENST00000557996 GRIN2BQ13224 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
IPO4-202ENST00000557996 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.21■■□□□ 1.79
IPO4-202ENST00000557996 OSCARQ8IYS5 282 aa26.2■■□□□ 1.78
IPO4-202ENST00000557996 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.18■■□□□ 1.78
IPO4-202ENST00000557996 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
IPO4-202ENST00000557996 TRIM41Q8WV44 630 aa26.15■■□□□ 1.78
IPO4-202ENST00000557996 FBLN2P98095 1184 aa26.14■■□□□ 1.78
IPO4-202ENST00000557996 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
IPO4-202ENST00000557996 KIF27Q86VH2 1401 aa26.09■■□□□ 1.77
IPO4-202ENST00000557996 PBRM1Q86U86 1689 aa26.09■■□□□ 1.77
IPO4-202ENST00000557996 SYNJ2O15056 1496 aa26.06■■□□□ 1.76
IPO4-202ENST00000557996 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.06■■□□□ 1.76
IPO4-202ENST00000557996 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26■■□□□ 1.75
IPO4-202ENST00000557996 CHD1O14646 1710 aa25.99■■□□□ 1.75
IPO4-202ENST00000557996 IGF1RP08069 1367 aa25.97■■□□□ 1.75
IPO4-202ENST00000557996 ADAMTS12P58397 1594 aa25.95■■□□□ 1.75
IPO4-202ENST00000557996 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.92■■□□□ 1.74
IPO4-202ENST00000557996 GRIN2AQ12879 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
IPO4-202ENST00000557996 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.86■■□□□ 1.73
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IPO4-202ENST00000557996 CUL7Q14999 1698 aa25.8■■□□□ 1.72
IPO4-202ENST00000557996 NUP160Q12769 1436 aa25.8■■□□□ 1.72
IPO4-202ENST00000557996 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.79■■□□□ 1.72
IPO4-202ENST00000557996 CEP170Q5SW79 1584 aa25.73■■□□□ 1.71
IPO4-202ENST00000557996 EEA1Q15075 1411 aa25.69■■□□□ 1.7
IPO4-202ENST00000557996 ARHGEF11O15085 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
IPO4-202ENST00000557996 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.67■■□□□ 1.7
IPO4-202ENST00000557996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.67■■□□□ 1.7
IPO4-202ENST00000557996 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
IPO4-202ENST00000557996 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
IPO4-202ENST00000557996 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
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