Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAX9P55771 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX9P55771 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX9P55771 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX9P55771 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms