Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC1P48995 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms