Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VHLP40337 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VHLP40337 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VHLP40337 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VHLP40337 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VHLP40337 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VHLP40337 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VHLP40337 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VHLP40337 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms