Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CEACAM6P40199 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms