Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGP37231 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGP37231 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGP37231 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGP37231 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGP37231 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGP37231 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGP37231 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGP37231 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGP37231 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms