Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALB2P22676 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALB2P22676 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALB2P22676 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALB2P22676 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALB2P22676 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALB2P22676 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALB2P22676 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms