Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CENPBP07199 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CENPBP07199 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CENPBP07199 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPBP07199 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPBP07199 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPBP07199 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPBP07199 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CENPBP07199 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPBP07199 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CENPBP07199 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPBP07199 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPBP07199 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPBP07199 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPBP07199 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPBP07199 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CENPBP07199 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPBP07199 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CENPBP07199 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPBP07199 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPBP07199 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPBP07199 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPBP07199 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPBP07199 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms