Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHBGP04278 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SHBGP04278 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHBGP04278 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHBGP04278 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHBGP04278 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHBGP04278 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBGP04278 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHBGP04278 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms