Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK3BL2E5RIL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms