Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AP003352.1-201ENST00000501016 1989 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms