Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms