Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA3Q9UI47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms