Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX25Q9UHL0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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