Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 320.64■□□□□ 0.891e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 512.8□□□□□ -0.361e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 511.73□□□□□ -0.531e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 37.57□□□□□ -1.21e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 34.13□□□□□ -1.751e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)2.57□□□□□ -21e-22■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.924e-7■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.544e-7■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 526.53■■□□□ 1.843e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.313e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 223.03■■□□□ 1.283e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 522.64■■□□□ 1.213e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-204ENST00000573158 627 ntTSL 320.13■□□□□ 0.813e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-205ENST00000574206 683 ntTSL 319.88■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 FN3KRP-209ENST00000577128 515 ntTSL 515.36■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 16.8
AATFQ9NY61 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 227.62■■■□□ 2.012e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.626e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.486e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.456e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 423.79■■□□□ 1.46e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.116e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.876e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.746e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 518.83■□□□□ 0.616e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.566e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-204ENST00000436545 680 ntTSL 318.39■□□□□ 0.536e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.56e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.486e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 PTGES3L-AARSD1-205ENST00000423601 584 ntTSL 317.96■□□□□ 0.476e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 216.42■□□□□ 0.226e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-217ENST00000591910 726 ntTSL 315.5■□□□□ 0.076e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-205ENST00000441280 983 ntTSL 214.77□□□□□ -0.056e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-206ENST00000450475 783 ntTSL 514.6□□□□□ -0.076e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 514.15□□□□□ -0.146e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-203ENST00000430739 752 ntTSL 314.12□□□□□ -0.156e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.316e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 AARSD1-201ENST00000416949 478 ntTSL 412.23□□□□□ -0.456e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 HNRNPAB-203ENST00000504796 578 ntTSL 210.46□□□□□ -0.736e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-14■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.146e-8■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.733e-6■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)19.13■□□□□ 0.653e-6■■■□□ 16.7
AATFQ9NY61 ZNF316-203ENST00000614588 939 ntTSL 325.99■■□□□ 1.752e-6■■■□□ 16.6
AATFQ9NY61 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 219.15■□□□□ 0.664e-7■■■□□ 16.6
AATFQ9NY61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.325e-7■■■□□ 16.6
AATFQ9NY61 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-6■■■□□ 16.5
AATFQ9NY61 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 16.5
AATFQ9NY61 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.397e-6■■■□□ 16.5
AATFQ9NY61 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-6■■■□□ 16.5
AATFQ9NY61 RNF11-203ENST00000494873 953 ntTSL 328.09■■■□□ 2.091e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 423.48■■□□□ 1.351e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 322.96■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 221.49■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 321.43■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 321.43■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 220.44■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 319.1■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 517.47■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-210ENST00000432179 572 ntTSL 417.27■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-254ENST00000456286 807 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 514.78□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 314.58□□□□□ -0.081e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.4
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