Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSG2

C1orf112, Uncharacterized protein C1orf112, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf112Q9NSG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf112Q9NSG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf112Q9NSG2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms