Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE7BQ9NP56 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE7BQ9NP56 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms