Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC32Q9BV29 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC32Q9BV29 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms