Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VOPP1Q96AW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms