Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms