Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4XQ8N0W4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4XQ8N0W4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms