Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFR1Q86XK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFR1Q86XK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms