Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOFQ13790 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOFQ13790 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOFQ13790 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOFQ13790 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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