Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms