Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms