Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSNP06396 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSNP06396 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSNP06396 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSNP06396 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSNP06396 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSNP06396 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSNP06396 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms