Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM13AO94988 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM13AO94988 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms