Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCATO75600 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCATO75600 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCATO75600 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCATO75600 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCATO75600 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCATO75600 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCATO75600 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCATO75600 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCATO75600 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCATO75600 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCATO75600 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCATO75600 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCATO75600 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms