Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ2O43526 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms